Система органов управления ОАО «ФосАгро» включает в себя:
- Общее собрание акционеров — высший орган управления, посредством которого акционеры реализуют свое право на участие в управлении Обществом;
- Совет директоров — орган управления, отвечающий за общее руководство деятельностью компании и контролирующий деятельность исполнительного органа. Совет директоров устанавливает стратегические задачи Общества, принимая во внимание достаточность финансовых и людских ресурсов для их достижения, основываясь на надлежащей разумной оценке предпринимательских рисков, и при условии чёткого понимания принимаемых на себя обязательств перед акционерами.
- единоличный исполнительный орган (Генеральный директор) — орган управления, осуществляющий руководство текущей деятельностью Общества и реализующий стратегию, определенную Советом директоров и акционерами. К компетенции Генерального директора относятся все вопросы руководства текущей деятельностью Общества, за исключением вопросов, отнесенных к компетенции общего собрания акционеров или Совета директоров Общества. Генеральный директор предоставляет Совету директоров ежеквартальные отчеты о своей деятельности.
Организация взаимодействия между Обществом и его акционерами, работа по подготовке общего собрания акционеров, организация работы Совета директоров возложены на аппарат Корпоративного секретаря Общества. Корпоративный секретарь функционально подчинен и подотчетен Совету директоров, а административно — единоличному исполнительному органу (Генеральному директору) Общества.