Группа владеет значительными запасами высококачественной апатит-нефелиновой руды с очень низким уровнем радиоактивности и содержанием тяжёлых металлов.
Оценённые по состоянию на 1 июня 2011 года в соответствии с кодексом JORC, резервы и запасы состояли из доказанных и вероятных запасов в 771,4 миллионов тонн, а также оцененных и перспективных запасов (включая резервы) в 2 074 миллионов тонн. Существующая ресурсная база группы позволяет ей поддерживать производство апатитового концентрата с высоким содержанием полезного вещества на текущем уровне добычи в течение 75 лет. Руда ФосАгро богатая различными соединениями включает в себя 280 миллионов тонн запасов Al2O3 (оксида алюминия), что является самыми большими запасами в России, а также крупные залежи редкоземельных металлов (41% от всех российских запасов) и другие полезные элементы, например, двуокись титана.